Parafia powstała w XV w., pierwszy kościół był drewniany. Liber Beneficjorum Łaskiego z 1510 r. informuje, iż we wsi „Bąbelno” był kościół parafialny pw. Narodzenia Najświętszej Maryi Panny i św. Mikołaja. Po pożarze ok. 1511 r. zbudowano nowy kościół. W l. 1548-1618 był on w rękach innowierców. W 1657 r. okolicę spustoszyli Szwedzi, którzy wkroczyli do Bebelna w Wielkanoc i zniszczyli kościół. Kościół był też kilkakrotnie rabowany. Z początkiem XVIII w. była już pilna konieczność budowy nowej świątyni w Bebelnie. Jej fundatorami w 1745 r. byli Antoni i Karol Bystrzanowscy, dziedzice Bebelna.
Jest to kościół modrzewiowy, zrębowej konstrukcji, jednonawowy. W 1777 r. dobudowano doń zakrystię i kruchtę. Był on także rozbudowywany w 1901 r. W ołtarzu głównym z 1894 r. - obraz Najświętszej Maryi Panny (na zasuwie – drugi patron św. Mikołaj). Na obrazie – zgodnie z relacją ks. Wiśniewskiego - w 1778 r. było 17 wotów (większość z nich zrabowali Moskale w 1794 r.). Ołtarze boczne z XIX w., fragmentarycznie ze starszą ornamentacją. Zabytkowe także tabernakulum, na tęczy – krucyfiks, a na wysokości bocznego ołtarza – współczesna figura Matki Bożej Fatimskiej.
Czy wiesz że...
Bebelno należało do rodu Długoszów, z którego pochodził historyk Jan Długosz . Pisze ks. Jan Wiśniewski w swej monografii o kościołach diecezji: „Parafia istnieje w XV wieku. Bebelno należało do Jana Długosza, ojca historyka; w połowie XV w. ma tę wieś najstarszy z jego sześciu synów Janów – Jan Długosz. Od Długoszów kościół otrzymał sadzawkę (…). Na południe od dzisiejszej plebanii, między Dziadówkami a Górną Wsią (nazwy części Bebelna), jest miejsce otoczone rowem w kształcie kwadratu, na którem stał ongi dawny kościół. Znajdowano tam kafle polewane, a na nich były wyobrażone sceny z historii świętej: Adam i Ewa w raju, Kain zabija Abla i in. Wyorano tam nawet kropielnicę, lecz ją ciemni ludzie zniszczyli. Lud uważa ten plac za miejsce pokuty…”.
Od 1999 r. w parafii jest figura Matki Bożej Fatimskiej, poświęcona przez biskupa fatimskiego i ofiarowana przez darczyńcę ze Szwajcarii. W parafii jest podtrzymywany kult fatimski.
